HAVCR1

HAVCR1
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 5DZO, 5F70
Идентификаторы
Псевдонимы	HAVCR1, HAVCR, HAVCR-1, KIM-1, KIM1, TIM, TIM-1, TIM1, TIMD-1, TIMD1, CD365, hepatitis A virus cellular receptor 1
Внешние ID	OMIM: 606518 MGI: 2159680 HomoloGene: 134424 GeneCards: HAVCR1
Расположение гена (человек) Хр. 5-я хромосома человека[1] Локус 5q33.3 Начало 157,029,413 bp[1] Конец 157,059,119 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 11-я хромосома мыши[2] Локус 11|11 B1.1 Начало 46,625,907 bp[2] Конец 46,670,405 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в epithelium of colon Наибольшая экспрессия в decidua secondary oocyte primary oocyte proximal tubule Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция virus receptor activity Компонент клетки часть мембраны motile cilium мембрана Биологический процесс вирусный процесс viral entry into host cell Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 26762 171283 Ensembl ENSG00000113249 ENSMUSG00000040405 UniProt Q96D42 Q5QNS5 RefSeq (мРНК) NM_001099414 NM_001173393 NM_001308156 NM_012206 NM_001166631 NM_001166632 NM_134248 RefSeq (белок) NP_001166864 NP_001295085 NP_036338 NP_001160103 NP_001160104 NP_599009 Локус (UCSC) Chr 5: 157.03 – 157.06 Mb Chr 11: 46.63 – 46.67 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

HAVCR1, или TIM-1 (англ. Hepatitis A virus cellular receptor 1, или англ. T-cell immunoglobulin and mucin domain 1 (TIM-1) ) — мембранный белок, продукт гена HAVCR1^[5][6][7]. Член семейства белков TIM (T cell transmembrane, immunoglobulin, and mucin), которые играют критическую роль в регулировании активности иммунных клеток, в особенности в ответ на вирусную инфекцию. Семейство включает 8 генов (от TIM-1 до TIM-8), из которых у человека присутствуют 3: TIM-1, TIM-3 и TIM-4. Кроме этого, белок участвует в процессах аллергического ответа, астмы и толерантности к транспланту.

1. ↑ ^{1 2 3} GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000113249 - Ensembl, May 2017
2. ↑ ^{1 2 3} GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040405 - Ensembl, May 2017
3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. ↑ Feigelstock D., Thompson P., Mattoo P., Zhang Y., Kaplan G. G. The human homolog of HAVcr-1 codes for a hepatitis A virus cellular receptor (англ.) // Journal of Virology^[англ.] : journal. — 1998. — August (vol. 72, no. 8). — P. 6621—6628. — PMID 9658108. — PMC 109848.
6. ↑ McIntire J. J., Umetsu S. E., Akbari O., Potter M., Kuchroo V. K., Barsh G. S., Freeman G. J., Umetsu D. T., DeKruyff R. H. Identification of Tapr (an airway hyperreactivity regulatory locus) and the linked Tim gene family (англ.) // Nature Immunology : journal. — 2001. — November (vol. 2, no. 12). — P. 1109—1116. — doi:10.1038/ni739. — PMID 11725301.
7. ↑ Entrez Gene: HAVCR1 hepatitis A virus cellular receptor 1  (неопр.).